L'utilisation de l'eau pour les soins et la rééducation des animaux remonte à l'Antiquité. Par exemple, les Grecs et les Romains de l'Antiquité utilisaient l'eau de mer pour soigner les chevaux et autres animaux qui combattaient dans les guerres. Au cours des dernières décennies, l'hydrothérapie animale est devenue un domaine important de la physiothérapie et de la rééducation vétérinaires. L'hydrothérapie canine moderne a été introduite au Royaume-Uni et aux États-Unis dans les années 1980 et s'est depuis répandue dans le monde entier. Aujourd'hui, il existe des centres d'hydrothérapie spécialisés qui disposent d'une grande variété d'équipements, tels que des tapis roulants sous-marins, des bains à remous et des piscines, afin de maximiser l'efficacité de la thérapie.