Het gebruik van water om dieren te genezen en te revalideren gaat terug tot de oudheid. De oude Grieken en Romeinen gebruikten al zeewater om paarden te behandelen en verwondingen bij militaire dieren te behandelen. De moderne hydrotherapie voor honden werd in de jaren 1980 ontwikkeld in Engeland en de Verenigde Staten en heeft zich over de hele wereld verspreid. Tegenwoordig zijn er gespecialiseerde hydrotherapiefaciliteiten met speciale onderwaterloopbanden, whirlpools en zwembaden, met verschillende soorten apparatuur om de voordelen van de therapie te maximaliseren.