L'utilisation de l'eau pour la guérison et la rééducation des animaux remonte à l'Antiquité. Les Grecs et les Romains de l'Antiquité utilisaient l'eau de mer pour soigner les chevaux et guérir les blessures des animaux militaires. Au cours des dernières décennies, l'hydrothérapie animale est devenue un domaine important de la rééducation et de la physiothérapie des animaux. Cependant, l'hydrothérapie moderne pour chiens a été introduite au Royaume-Uni et aux États-Unis dans les années 1980 et s'est depuis répandue dans le monde entier. Aujourd'hui, il existe des installations d'hydrothérapie spécialisées, avec des tapis roulants sous-marins, des bains à remous et des piscines, avec différents types d'équipements pour maximiser les bénéfices de la thérapie.